《炸裂吧巨棒》是一部充满热血与青春躁动的运动竞技漫画，讲述了在棒球名校青叶高中，拥有“天才打者”称号的冷酷王牌江川瞬，与半路出家、却有着野兽般直觉与无穷体能的野性少年大谷翔平，从互相看不顺眼的最强对手，被迫组成命运般的“电池组合”（投捕搭档）。他们性格截然相反，在球场上摩擦不断，却又在为冲击全国大赛的征途中，因为对胜利的极致渴望而逐渐理解彼此。每一次挥棒、每一次投球都伴随着炸裂的轰鸣，他们不仅是并肩作战的队友，更是点燃彼此斗志、突破自身极限的唯一存在，共同在钻石场上谱写最炽热的青春战歌。
全国大赛决赛前夜，江川发现大谷的投球姿势有细微偏差，可能导致手肘受伤。两人在空无一人的球场爆发激烈争吵，江川用自己过去因伤病错失甲子园的惨痛经历训斥大谷。最终，大谷理解了江川的严厉背后是深切的关怀，两人首次达成真正的投球默契，决定在明天的决赛上，用一颗撕裂空气的“命运重球”赌上所有未来。
在地区预选赛的关键一战中，江川固执地拒绝大谷的配球建议，导致被对方击出逆转满贯炮。赛后，两人在更衣室爆发肢体冲突，大谷直言江川的“天才”自尊正在毁掉球队。这次危机让教练介入，并强制他们进行一周的“心灵沟通”特训，否则将双双失去正选资格。
大谷翔平在练习赛中，面对职业级投手，完全凭借本能的动态视力和惊人的反应速度，将一颗失控的触身球硬生生击出全垒打墙。这一击不仅震惊全场，也让向来高傲的江川第一次正视这个“门外汉”的恐怖天赋，两人之间敌对的关系出现了第一次松动。
江川瞬独自加练到深夜，被大谷撞见他对着墙壁反复投球，嘴里默念着一个名字。回忆杀展开，原来江川过去有一个同样天才的捕手搭档，却因接他的超高速球导致手骨碎裂而告别棒球。这是江川封闭内心的根源，他不再相信任何人能接住他的球。
球队经理在统计新队员数据时，发现大谷翔平的惊人臂力，但棒球经验几乎为零。而王牌投手江川瞬又急需一个能接住他魔球的捕手。在经理的“阴谋”下，两人被强行绑定为投捕搭档，第一次练习就以大谷被江川的球砸中胸口、两人互殴收场。
从未接触过棒球的高一新生大谷翔平，因在操场上一拳将足球踢进球门，被棒球部经理看中他怪物般的身体素质，连哄带骗地带到了青叶高中棒球场。恰逢王牌江川瞬投出一记教科书式的指叉球，那球破空的声音深深震撼了大谷，命运的齿轮开始转动。